แป้งมันสำปะหลังดัดแปรช่วยลดต้นทุนการผลิตโดยนำมาทดแทนส่วนผสมอื่น ๆ เช่น เจลาติน, gum arabic โดยปริมาณที่ทดแทนนั้นขึ้นกับชนิดของขนมและวิธีการผลิต อีกทั้งยังมีคุณสมบัติช่วยให้ผลิตภัณฑ์มีความเหนียวนุ่ม

 ใช้แป้งมันสำปะหลังดัดแปรที่มีความหนืดต่ำ โดยเฉพาะแป้งมันสำปะหลังดัดแปรที่มี amylose ต่ำกว่าแป้งชนิดอื่น ช่วยให้เนื้อแยมมีความเหนียวนุ่ม ใส ตลอดอายุผลิตภัณฑ์ และอุ้มน้ำได้ดีตลอดอายุการเก็บผลิตภัณฑ์

   แป้งมันสำปะหลังดัดแ ปร และdextrins ช่วยเคลือบลูกอมและช็อคโกแลตให้สวยงาม ลดการแตกร้าวของผิวขนมที่เกิดจากการกระแทกระหว่างขนส่ง
 แป้งมันสำปะหลังดัดแปรสร้างเนื้อขนมได้หลากหลายรูปแบบ ขึ้นอยู่กับส่วนผสมของขนมและกรรมวิธีการผลิตเพื่อให้ได้เนื้อขนมที่มีลักษณะเฉพาะ